Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Samd11Q1RNF8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samd11Q1RNF8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Samd11Q1RNF8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Samd11Q1RNF8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Samd11Q1RNF8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Samd11Q1RNF8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Samd11Q1RNF8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Samd11Q1RNF8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samd11Q1RNF8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms