Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klrb1Q0ZUP1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klrb1Q0ZUP1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klrb1Q0ZUP1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klrb1Q0ZUP1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klrb1Q0ZUP1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klrb1Q0ZUP1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klrb1Q0ZUP1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klrb1Q0ZUP1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klrb1Q0ZUP1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klrb1Q0ZUP1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klrb1Q0ZUP1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klrb1Q0ZUP1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klrb1Q0ZUP1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klrb1Q0ZUP1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrb1Q0ZUP1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrb1Q0ZUP1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrb1Q0ZUP1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms