Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtel1Q0VGM9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtel1Q0VGM9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtel1Q0VGM9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtel1Q0VGM9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtel1Q0VGM9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtel1Q0VGM9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtel1Q0VGM9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtel1Q0VGM9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtel1Q0VGM9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtel1Q0VGM9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtel1Q0VGM9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtel1Q0VGM9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtel1Q0VGM9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms