Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pglyrp4Q0VB07 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pglyrp4Q0VB07 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pglyrp4Q0VB07 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pglyrp4Q0VB07 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms