Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab42Q0PD08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab42Q0PD08 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab42Q0PD08 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab42Q0PD08 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms