Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r181Q0P547 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r181Q0P547 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r181Q0P547 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r181Q0P547 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r181Q0P547 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms