Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TrioQ0KL02 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TrioQ0KL02 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TrioQ0KL02 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TrioQ0KL02 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrioQ0KL02 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TrioQ0KL02 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrioQ0KL02 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrioQ0KL02 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms