Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Gdf9Q07105 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Gdf9Q07105 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Gdf9Q07105 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
Gdf9Q07105 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Gdf9Q07105 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Gdf9Q07105 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Gdf9Q07105 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Gdf9Q07105 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Gdf9Q07105 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gdf9Q07105 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gdf9Q07105 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Gdf9Q07105 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Gdf9Q07105 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,83■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Gdf9Q07105 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Gdf9Q07105 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,7■■□□□ 1,39
Gdf9Q07105 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Gdf9Q07105 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23,58■■□□□ 1,37
Gdf9Q07105 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Gdf9Q07105 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Gdf9Q07105 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Gdf9Q07105 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Gdf9Q07105 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,5 ms