Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cab39Q06138 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cab39Q06138 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cab39Q06138 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cab39Q06138 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cab39Q06138 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cab39Q06138 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cab39Q06138 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cab39Q06138 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cab39Q06138 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cab39Q06138 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cab39Q06138 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms