Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsu1Q01730 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rsu1Q01730 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsu1Q01730 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsu1Q01730 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms