Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou1f1Q00286 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou1f1Q00286 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pou1f1Q00286 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou1f1Q00286 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou1f1Q00286 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms