Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Xrn1P97789 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Xrn1P97789 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Xrn1P97789 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Xrn1P97789 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Xrn1P97789 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Xrn1P97789 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Xrn1P97789 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Xrn1P97789 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Xrn1P97789 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Xrn1P97789 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Xrn1P97789 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Xrn1P97789 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Xrn1P97789 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Xrn1P97789 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Xrn1P97789 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Xrn1P97789 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Xrn1P97789 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Xrn1P97789 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Xrn1P97789 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Xrn1P97789 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Xrn1P97789 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Xrn1P97789 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Xrn1P97789 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Xrn1P97789 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Xrn1P97789 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Xrn1P97789 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Xrn1P97789 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Xrn1P97789 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Xrn1P97789 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Xrn1P97789 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Xrn1P97789 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Xrn1P97789 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Xrn1P97789 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Xrn1P97789 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Xrn1P97789 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Xrn1P97789 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Xrn1P97789 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Xrn1P97789 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Xrn1P97789 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Xrn1P97789 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Xrn1P97789 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Xrn1P97789 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Xrn1P97789 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Xrn1P97789 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Xrn1P97789 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Xrn1P97789 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Xrn1P97789 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Xrn1P97789 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms