Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arf1P84078 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arf1P84078 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arf1P84078 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arf1P84078 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arf1P84078 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf1P84078 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf1P84078 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf1P84078 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arf1P84078 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arf1P84078 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arf1P84078 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arf1P84078 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Arf1P84078 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf1P84078 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf1P84078 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf1P84078 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf1P84078 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf1P84078 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf1P84078 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf1P84078 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf1P84078 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf1P84078 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arf1P84078 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arf1P84078 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Arf1P84078 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arf1P84078 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf1P84078 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arf1P84078 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf1P84078 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arf1P84078 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf1P84078 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf1P84078 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf1P84078 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf1P84078 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arf1P84078 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arf1P84078 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arf1P84078 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf1P84078 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arf1P84078 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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