Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubg1P83887 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubg1P83887 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubg1P83887 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms