Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx1P81068 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx1P81068 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx1P81068 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx1P81068 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx1P81068 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx1P81068 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx1P81068 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx1P81068 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx1P81068 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx1P81068 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx1P81068 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx1P81068 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx1P81068 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Irx1P81068 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx1P81068 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx1P81068 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx1P81068 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx1P81068 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx1P81068 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx1P81068 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx1P81068 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx1P81068 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx1P81068 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx1P81068 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx1P81068 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx1P81068 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx1P81068 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx1P81068 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx1P81068 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx1P81068 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx1P81068 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx1P81068 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms