Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gfi1P70338 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gfi1P70338 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfi1P70338 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfi1P70338 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfi1P70338 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfi1P70338 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfi1P70338 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfi1P70338 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gfi1P70338 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfi1P70338 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gfi1P70338 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfi1P70338 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfi1P70338 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfi1P70338 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gfi1P70338 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms