Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad54lP70270 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad54lP70270 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad54lP70270 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad54lP70270 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad54lP70270 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad54lP70270 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad54lP70270 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad54lP70270 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad54lP70270 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad54lP70270 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad54lP70270 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad54lP70270 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad54lP70270 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad54lP70270 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad54lP70270 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad54lP70270 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms