Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actg1P63260 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actg1P63260 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actg1P63260 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actg1P63260 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Actg1P63260 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actg1P63260 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actg1P63260 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Actg1P63260 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actg1P63260 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actg1P63260 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actg1P63260 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actg1P63260 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actg1P63260 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actg1P63260 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Actg1P63260 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Actg1P63260 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Actg1P63260 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actg1P63260 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actg1P63260 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actg1P63260 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Actg1P63260 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actg1P63260 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actg1P63260 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms