Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp3P63024 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp3P63024 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp3P63024 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp3P63024 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms