Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d2P62838 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ube2d2P62838 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2d2P62838 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2P62838 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2P62838 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms