Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd3P62320 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd3P62320 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd3P62320 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms