Protein–RNA interactions for Protein: P62309

Snrpg, Small nuclear ribonucleoprotein G, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpgP62309 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SnrpgP62309 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpgP62309 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpgP62309 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpgP62309 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SnrpgP62309 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpgP62309 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms