Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem258P61166 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem258P61166 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem258P61166 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem258P61166 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem258P61166 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem258P61166 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem258P61166 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem258P61166 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem258P61166 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem258P61166 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem258P61166 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem258P61166 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem258P61166 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem258P61166 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem258P61166 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem258P61166 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem258P61166 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem258P61166 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem258P61166 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem258P61166 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem258P61166 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem258P61166 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem258P61166 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem258P61166 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem258P61166 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem258P61166 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem258P61166 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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