Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2kP61087 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2kP61087 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2kP61087 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2kP61087 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms