Protein–RNA interactions for Protein: P61027

Rab10, Ras-related protein Rab-10, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab10P61027 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab10P61027 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab10P61027 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab10P61027 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab10P61027 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab10P61027 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab10P61027 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab10P61027 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab10P61027 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab10P61027 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab10P61027 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab10P61027 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab10P61027 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab10P61027 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab10P61027 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab10P61027 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab10P61027 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab10P61027 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab10P61027 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab10P61027 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab10P61027 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab10P61027 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab10P61027 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab10P61027 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab10P61027 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab10P61027 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab10P61027 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab10P61027 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab10P61027 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab10P61027 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms