Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sem1P60897 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sem1P60897 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sem1P60897 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sem1P60897 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sem1P60897 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sem1P60897 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sem1P60897 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sem1P60897 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sem1P60897 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sem1P60897 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sem1P60897 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sem1P60897 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sem1P60897 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sem1P60897 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sem1P60897 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sem1P60897 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sem1P60897 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sem1P60897 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sem1P60897 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sem1P60897 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sem1P60897 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sem1P60897 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sem1P60897 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms