Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdsp1P58466 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctdsp1P58466 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctdsp1P58466 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdsp1P58466 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms