Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NcstnP57716 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NcstnP57716 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NcstnP57716 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcstnP57716 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NcstnP57716 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NcstnP57716 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NcstnP57716 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NcstnP57716 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NcstnP57716 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NcstnP57716 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NcstnP57716 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NcstnP57716 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NcstnP57716 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NcstnP57716 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NcstnP57716 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NcstnP57716 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NcstnP57716 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NcstnP57716 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NcstnP57716 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NcstnP57716 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NcstnP57716 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NcstnP57716 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NcstnP57716 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NcstnP57716 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NcstnP57716 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NcstnP57716 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NcstnP57716 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NcstnP57716 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms