Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defb1P56386 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defb1P56386 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defb1P56386 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defb1P56386 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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