Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psmc4P54775 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psmc4P54775 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psmc4P54775 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psmc4P54775 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psmc4P54775 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psmc4P54775 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psmc4P54775 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psmc4P54775 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psmc4P54775 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmc4P54775 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psmc4P54775 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psmc4P54775 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psmc4P54775 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psmc4P54775 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Psmc4P54775 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psmc4P54775 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psmc4P54775 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Psmc4P54775 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmc4P54775 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Psmc4P54775 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psmc4P54775 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psmc4P54775 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Psmc4P54775 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psmc4P54775 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psmc4P54775 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psmc4P54775 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Psmc4P54775 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Psmc4P54775 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psmc4P54775 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psmc4P54775 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psmc4P54775 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmc4P54775 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms