Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FmodP50608 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FmodP50608 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FmodP50608 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FmodP50608 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FmodP50608 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FmodP50608 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FmodP50608 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FmodP50608 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FmodP50608 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FmodP50608 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FmodP50608 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FmodP50608 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FmodP50608 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FmodP50608 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FmodP50608 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FmodP50608 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FmodP50608 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FmodP50608 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FmodP50608 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FmodP50608 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FmodP50608 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FmodP50608 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FmodP50608 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FmodP50608 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FmodP50608 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FmodP50608 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FmodP50608 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FmodP50608 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FmodP50608 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FmodP50608 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FmodP50608 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FmodP50608 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FmodP50608 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FmodP50608 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FmodP50608 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FmodP50608 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FmodP50608 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FmodP50608 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FmodP50608 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FmodP50608 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FmodP50608 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FmodP50608 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FmodP50608 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FmodP50608 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FmodP50608 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FmodP50608 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FmodP50608 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FmodP50608 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FmodP50608 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FmodP50608 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FmodP50608 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FmodP50608 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FmodP50608 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FmodP50608 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FmodP50608 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FmodP50608 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FmodP50608 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FmodP50608 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FmodP50608 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FmodP50608 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FmodP50608 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FmodP50608 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FmodP50608 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FmodP50608 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FmodP50608 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FmodP50608 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FmodP50608 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FmodP50608 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FmodP50608 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FmodP50608 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FmodP50608 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
FmodP50608 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FmodP50608 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FmodP50608 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FmodP50608 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FmodP50608 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FmodP50608 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FmodP50608 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FmodP50608 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FmodP50608 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FmodP50608 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FmodP50608 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FmodP50608 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FmodP50608 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FmodP50608 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FmodP50608 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FmodP50608 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FmodP50608 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FmodP50608 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FmodP50608 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FmodP50608 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FmodP50608 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FmodP50608 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FmodP50608 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FmodP50608 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FmodP50608 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FmodP50608 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FmodP50608 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FmodP50608 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms