Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BckdhaP50136 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BckdhaP50136 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BckdhaP50136 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BckdhaP50136 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BckdhaP50136 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BckdhaP50136 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BckdhaP50136 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BckdhaP50136 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BckdhaP50136 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BckdhaP50136 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BckdhaP50136 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BckdhaP50136 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BckdhaP50136 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BckdhaP50136 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BckdhaP50136 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BckdhaP50136 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BckdhaP50136 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms