Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp9P49962 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp9P49962 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp9P49962 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp9P49962 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp9P49962 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp9P49962 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp9P49962 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp9P49962 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp9P49962 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp9P49962 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp9P49962 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp9P49962 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp9P49962 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp9P49962 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp9P49962 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp9P49962 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp9P49962 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp9P49962 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp9P49962 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms