Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VegfbP49766 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VegfbP49766 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VegfbP49766 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VegfbP49766 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VegfbP49766 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VegfbP49766 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VegfbP49766 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VegfbP49766 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VegfbP49766 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VegfbP49766 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VegfbP49766 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VegfbP49766 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VegfbP49766 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VegfbP49766 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VegfbP49766 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VegfbP49766 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VegfbP49766 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VegfbP49766 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VegfbP49766 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VegfbP49766 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VegfbP49766 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VegfbP49766 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VegfbP49766 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VegfbP49766 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VegfbP49766 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VegfbP49766 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VegfbP49766 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VegfbP49766 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VegfbP49766 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms