Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psma2P49722 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Psma2P49722 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psma2P49722 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psma2P49722 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psma2P49722 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psma2P49722 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma2P49722 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma2P49722 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Psma2P49722 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psma2P49722 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma2P49722 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma2P49722 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psma2P49722 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Psma2P49722 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psma2P49722 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma2P49722 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma2P49722 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma2P49722 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma2P49722 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma2P49722 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma2P49722 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psma2P49722 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psma2P49722 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psma2P49722 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psma2P49722 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psma2P49722 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma2P49722 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma2P49722 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psma2P49722 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psma2P49722 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psma2P49722 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psma2P49722 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psma2P49722 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psma2P49722 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms