Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtpreP49446 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtpreP49446 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PtpreP49446 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtpreP49446 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtpreP49446 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtpreP49446 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpreP49446 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtpreP49446 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtpreP49446 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtpreP49446 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtpreP49446 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtpreP49446 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PtpreP49446 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtpreP49446 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtpreP49446 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpreP49446 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtpreP49446 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtpreP49446 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtpreP49446 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpreP49446 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpreP49446 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpreP49446 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtpreP49446 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtpreP49446 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtpreP49446 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtpreP49446 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtpreP49446 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PtpreP49446 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtpreP49446 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtpreP49446 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtpreP49446 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpreP49446 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpreP49446 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpreP49446 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpreP49446 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PtpreP49446 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpreP49446 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtpreP49446 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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