Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LmnaP48678 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LmnaP48678 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LmnaP48678 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LmnaP48678 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LmnaP48678 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LmnaP48678 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LmnaP48678 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LmnaP48678 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LmnaP48678 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LmnaP48678 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LmnaP48678 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LmnaP48678 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LmnaP48678 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LmnaP48678 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LmnaP48678 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LmnaP48678 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LmnaP48678 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LmnaP48678 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LmnaP48678 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LmnaP48678 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LmnaP48678 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LmnaP48678 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms