Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbx2P48031 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbx2P48031 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbx2P48031 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbx2P48031 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbx2P48031 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx2P48031 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbx2P48031 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbx2P48031 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbx2P48031 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms