Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Igfbp3P47878 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Igfbp3P47878 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igfbp3P47878 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Igfbp3P47878 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Igfbp3P47878 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Igfbp3P47878 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms