Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stt3aP46978 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stt3aP46978 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stt3aP46978 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stt3aP46978 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stt3aP46978 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stt3aP46978 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stt3aP46978 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stt3aP46978 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stt3aP46978 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stt3aP46978 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Stt3aP46978 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Stt3aP46978 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms