Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Syt1P46096 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Syt1P46096 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Syt1P46096 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Syt1P46096 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Syt1P46096 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Syt1P46096 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Syt1P46096 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Syt1P46096 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Syt1P46096 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Syt1P46096 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Syt1P46096 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Syt1P46096 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Syt1P46096 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Syt1P46096 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Syt1P46096 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Syt1P46096 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Syt1P46096 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Syt1P46096 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Syt1P46096 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Syt1P46096 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Syt1P46096 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Syt1P46096 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Syt1P46096 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Syt1P46096 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Syt1P46096 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Syt1P46096 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Syt1P46096 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Syt1P46096 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Syt1P46096 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Syt1P46096 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Syt1P46096 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Syt1P46096 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Syt1P46096 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Syt1P46096 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Syt1P46096 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Syt1P46096 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Syt1P46096 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Syt1P46096 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Syt1P46096 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Syt1P46096 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Syt1P46096 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Syt1P46096 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,8 ms