Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh2P43247 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh2P43247 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh2P43247 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh2P43247 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh2P43247 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh2P43247 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msh2P43247 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msh2P43247 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msh2P43247 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msh2P43247 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msh2P43247 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Msh2P43247 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msh2P43247 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh2P43247 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh2P43247 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh2P43247 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh2P43247 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh2P43247 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Msh2P43247 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh2P43247 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msh2P43247 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh2P43247 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh2P43247 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh2P43247 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh2P43247 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msh2P43247 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msh2P43247 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msh2P43247 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msh2P43247 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Msh2P43247 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Msh2P43247 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh2P43247 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Msh2P43247 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh2P43247 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh2P43247 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh2P43247 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms