Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp9P41245 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp9P41245 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp9P41245 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp9P41245 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms