Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Col18a1P39061 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Col18a1P39061 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col18a1P39061 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Col18a1P39061 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Col18a1P39061 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Col18a1P39061 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Col18a1P39061 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Col18a1P39061 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Col18a1P39061 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Col18a1P39061 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Col18a1P39061 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Col18a1P39061 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Col18a1P39061 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Col18a1P39061 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Col18a1P39061 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Col18a1P39061 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Col18a1P39061 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Col18a1P39061 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Col18a1P39061 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Col18a1P39061 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Col18a1P39061 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Col18a1P39061 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Col18a1P39061 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Col18a1P39061 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Col18a1P39061 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col18a1P39061 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col18a1P39061 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Col18a1P39061 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Col18a1P39061 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Col18a1P39061 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Col18a1P39061 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col18a1P39061 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Col18a1P39061 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Col18a1P39061 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms