Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ly6dP35459 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ly6dP35459 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ly6dP35459 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ly6dP35459 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ly6dP35459 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ly6dP35459 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ly6dP35459 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ly6dP35459 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ly6dP35459 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ly6dP35459 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ly6dP35459 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ly6dP35459 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ly6dP35459 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ly6dP35459 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ly6dP35459 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ly6dP35459 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ly6dP35459 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ly6dP35459 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ly6dP35459 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ly6dP35459 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ly6dP35459 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ly6dP35459 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ly6dP35459 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ly6dP35459 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ly6dP35459 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ly6dP35459 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms