Protein–RNA interactions for Protein: P35283

Rab12, Ras-related protein Rab-12, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab12P35283 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab12P35283 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab12P35283 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab12P35283 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab12P35283 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab12P35283 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab12P35283 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab12P35283 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab12P35283 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab12P35283 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab12P35283 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab12P35283 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab12P35283 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab12P35283 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab12P35283 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab12P35283 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rab12P35283 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab12P35283 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab12P35283 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab12P35283 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab12P35283 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab12P35283 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab12P35283 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms