Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim2P33610 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim2P33610 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prim2P33610 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim2P33610 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim2P33610 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim2P33610 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim2P33610 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim2P33610 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim2P33610 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim2P33610 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim2P33610 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim2P33610 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim2P33610 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim2P33610 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim2P33610 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim2P33610 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prim2P33610 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms