Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxa10P31310 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa10P31310 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa10P31310 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa10P31310 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxa10P31310 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms