Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnnd1P30999 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnnd1P30999 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnnd1P30999 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctnnd1P30999 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnnd1P30999 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctnnd1P30999 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctnnd1P30999 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctnnd1P30999 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctnnd1P30999 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnnd1P30999 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ctnnd1P30999 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms