Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxd10P28359 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd10P28359 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxd10P28359 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hoxd10P28359 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxd10P28359 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxd10P28359 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxd10P28359 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxd10P28359 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxd10P28359 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxd10P28359 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxd10P28359 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxd10P28359 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxd10P28359 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd10P28359 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd10P28359 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxd10P28359 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd10P28359 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd10P28359 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd10P28359 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd10P28359 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd10P28359 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd10P28359 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxd10P28359 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxd10P28359 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms